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第5.3.2条款中对“收集证据”作出了规定：
应收集充足的证据，以便判定受审核方的EMS是否合乎审核准则。
审核证据的收集应来自面谈、文件审阅和对活动与情况的观察。应对偏离EMS审核准则的表现作出记录。
面谈取得的信息应通过从独立的来源获取支持信息予以核实，独立来源包括观察、记录和现有的测试结果。对无未能核实的信息应给以标识。
审核员应对有关的取样方案与程序进行审查，以确保取样与测量过程的有效质量控制。上海TS16949认证上海ISO9001认证
在现场审核时可以按环境管理体系的核心因素来审核，这些因素应包括：
─ 环境方针和法律要求；
─ 环境因素的确定和评审；
─ 环境影响的评价；
─ 环境目标、指标及管理方案的实施状况；
─ 环境体系的文件化程序；
─ 对生产操作进行的控制；
─ 对纠正和预防措施的跃进情况等。
在审核中除了通过面谈、观察和审阅文件等方法来收集证据外，还应充分利用有关事实的可验证信息来源如测量和试验结果以取得支持信息，并应对现场审核所获得的大量数据的准确性和恰当性进行分析评价；同时还应受审核方环境管理体系活动中的有关抽样方案的依据和程序进行审查，以确保受审核方环境管理体系活动部份的抽样和测量过程的有效控制。
例如，在识别废物的污染问题，可以考虑去寻找现场有没有如下情况：
─ 废物错放在有标签的料车中；
─ 未经分离的废物（减少循环利用的可能性）；
─ 可循环利用的废物却没有被循环利用；
─ 丢弃了有用的物质；
─ 有倾倒垃圾的迹象；
─ 废物料车上未贴标签（有可能将料放错）；
─ 料车未盖盖子（可能被风吹入杂物或雨水进入）；
─ 料车没有放稳（剩余的垃圾和滤液可能流到地面）。
在审核水体的排放时，可以考虑以下情况：
─ 废水被排放到哪些地表水体或水管中？环境敏感性的程序如何？有什么潜在影响、腐蚀、淤泥沉积、障碍物？国家河流管理部门对地表水所规定的级别是多少？下游用水的目的是什么？
─ 用什么样的处理装置或系统来减少水在排放时产生的污染？采用什么化学物质？用来进行处理的化学物质的成份是什么？处理的实施情况如何？什么时候进行维护？有什么措施可防止污水的溢出？
─ 排放到地表水和污水管中的废物的污染是什么？在加工过程中？材料贮存阶段？
─ 在以下的排放情况中，环境会受到什么损害？
─ 正常情况 异常情况 紧急情况
─ 发生什么事件会使地表水体或污水系统的质量受到影响？
─ 发生什么重大溢漏会影响地表水体或下水系统？
─ 是否有起诉或警告发生？
─ 在对管理层的审核时，应考虑询问：
─ 管理者对环境管理体系的理解和承诺；
─ 管理者对该地区及国家环境问题的了解；
─ 管理者对环境法律和法规的了解；
─ 对管理者及员工提供环境培训的情况；
─ 在环境问题上的内部和外部信息交流。
l 审核发现
ISO14001标准第5.3.3条款对审核发现作出规定：
审核组应对所有审核证据进行评审，以确定何处EMS不合乎审核准则。应确保我将发现的不符合清晰明确地形成文件，并以审核证据作为依据。
应与受审核方的有关负责人共同评议审核发现，以确认造成不符合的事实基础。
审核中发现的不符合的原因有三种：
─ 环境管理体系文件不符合ISO14001标准或其相应条款的要求，或不符合有关的环境法律或法规；
─ 没有执行环境管理体系文件或实际执行的是不符合的质量体系文件的规定；
─ 实施过程或具体工作没有成就，比如没达到所要求的结果。
一般将不符合项分为严重不符合、一般不符合和观察项三类。
─ 严重不符合是指以下情况：
环境管理体系与ISO14001标准或环境法律、法规要求不符合，或是整个体系严重失效，或是可能造成严重后果的不符合。
─ 一般不符合是指以下情况：
① 偶然没有遵守环境作业程序，造成后果不严重，或环境管理体系个别要求没有满足，被证实是小事件，对体系不会产生重要影响的不符合。
② 如果存在大量的一般不符合，综合考虑这些一般不符合时，要以导致体系的失误，由此产生一个严重不符合。
─ 有的审核机构会给出另一种不符合，称为“观察项”，观察项主要应用于以下情况：
① 存在问题但证据不足，需提醒注意的事项；
② 已发现问题苗头，但尚不能构成不符合，如发展下去有可能构成不合格事项；
③ 观察项不列入不符合报告，也不列入最后的审核报告中去，也有的认证公司会列入报告中。
下面是某审核机构执行预审时所发现的问题：
① 某设备上有油污，未放置吸油棉来作紧急应变；
② 个别二氧化碳干粉灭火器没有规定有效期；
③ 维修车间内废油污染地面的情形较多；
④ 实验室的化学剂使用后的清洁水直排入雨水沟；
⑤ 个别含有破坏氧层成分的灭火器仍在使用；
⑥ 某车间报警器的电线没有适当的防护措施；
⑦ 出水口的监测数据与质量指标的项目不符合；
⑧ 图纸上污水处理场的排放管未连到排水口处，且内部流向不明确；
⑨ 空压机房的水沟内的油污，可能随雨水直接排出；
⑩ 最近一次内审未完全包含ISO14001的全部要素。
