在上述的废物、油、空气供给正常时，一燃室炉膛温度控制在800℃～900℃，分解有毒物体。焚烧后的灰渣清出，外运固化填埋。焚烧产生的烟气则进入二燃室。
焚烧易于产生二恶英等剧毒的物质，对环境和人体造成巨大威胁，因此焚烧产生的烟气污染一直都是焚烧技术中亟待解决的关键问题和该技术遭到公众反对的主要原因。鉴于此，一套合格的焚烧系统必须配备有烟气净化系统，该系统必须包括急冷装置、除酸装置、及袋式除尘器。烟气中未燃烬的有害物质在二燃室中进一步销毁。为了使未燃烬物质彻底分解，达到排放要求，二燃室配置了独特的二次供风装置，以保证烟气在高温下同氧气充分接触 (如果业主需要，其供风量可根据水冷集尘器出口烟气的含氧量进行调整)。二燃室内温度控制在1100℃～1320℃，并确保停留时间＞3s，使烟气在炉内充分分解焚烧，从而达到较高的分解率。同时，烟气中大粒径的粉尘落入二燃室底部完成初级除尘。
